《孤岛惊魂6》目前还远算不上完美，育碧开放世界游戏存在的bug都能在这里找到。此外，在游戏设计上，其中一个方面让玩家非常苦恼：敌人重生问题。
《孤岛惊魂6》和系列之前游戏其中一个不同就是加入了敌人重生这一新功能，确保玩家有打不完的敌人。遗憾的是，更多要击杀的敌人，尤其是那些已经杀了的，并不是玩家想要的。
Reddit上一名玩家抱怨说敌人重生不断地毁掉他们钟爱的潜行玩法体验。
“我是一名潜行玩家，我喜欢《孤岛惊魂》的潜行，对我来说真的很有趣。然而，当我绕过一个基地，在我尾随标记他们后敌人在基地的对面重置时，潜行就变得不那么有趣了。当我绕过一个基地，杀死敌人时，我需要一次又一次地杀死相同的敌人，让自己处于不舒服的位置以确保敌人不会重生或重置。得了吧，这看起来本应该在测试中就能发现的问题。”
潜行玩法占领据点的体验被毁掉主要原因在于敌人重生地太快。当玩家被发现不得不与大量敌人交战时，它也会带来问题。越来越多的敌人将不断地从无所不在的地方冒出来挑战玩家，并将战斗拖得比之前的游戏更久。
一些玩家希望育碧能彻底移除这一机制，不过育碧很有可能会发布一个补丁，降低敌人重生的频率或是数量。
